Nuestro último artículo, con los resultados del estudio de metabarcoding realizado en las praderas de Posidonia oceanica en Cabrera, acaba de ser publicado en Frontiers in Marine Science.

Esta es la referencia.

Turon X, Zarcero J, Antich A, Wangensteen OS, Ballesteros E, Cebrian E, Marco-Méndez C, Alcoverro T. 2023. Metabarcoding the eukaryotic community of a threatened, iconic Mediterranean habitat: Posidonia oceanica seagrass meadows. Frontiers in Marine Science, 10:1145883. DOI: 10.3389/fmars.2023.1145883.

Es un artículo en “open Access” y se puede obtener en esta dirección:

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmars.2023.1145883/full

Esperamos que lo encontréis interesante y disfrutéis su lectura, este es el resumen:

 

Frente al ritmo acelerado de extinción de especies en todo el mundo, poseer tener evaluaciones robustas de la biodiversidad es esencial, tanto para tener líneas de base como para detectar potenciales declives. Las técnicas de metabarcoding de ADN permiten exhaustivas estimas de biodiversidad tanto en ambientes marinos como terrestres. Sin embargo, esos métodos deben adaptarse y estandarizarse para cada ecosistema para ser efectivos. Las praderas de fanerógamas marinas están entre los hábitats marinos más diversos e irremplazables en términos de los servicios ecosistémicos que brindan, sin embargo, la técnica de metabarcoding nunca se ha implementado para estos sistemas. En este estudio, desarrollamos y probamos un protocolo para el metabarcoding de la comunidad eucariota de las praderas de la especie icónica Posidonia oceanica L. (Delile). Esta fanerógama es la especie formadora de hábitat principal en las aguas costeras del Mediterráneo y se la conoce por su alta diversidad debido a la complejidad estructural generadas por sus hojas y rizomas. Este hábitat está experimentando un retroceso en todo su rango, y se necesitan con urgencia métodos rápidos y eficientes para su biomonitorización y detección de cambios tempranos. Proponemos un método que implica el muestreo directo de la comunidad, recolectando y procesando las hojas y rizoma por separado. Para probar la utilidad del método en la distinción entre diferentes condiciones de pradera, muestreamos dos praderas distintas que difieren en sus condiciones predominantes de viento y oleaje, y un arrecife rocoso cercano para comparación. Hemos adaptado un método y un proceso informático para el metabarcoding de COI utilizando cebadores generalistas para evaluar la diversidad de eucariotas presentes. Detectamos una alta diversidad en las dos praderas analizadas (3.350 unidades taxonómicas operativas moleculares, dominadas por Metazoa y Archaeplastida) y una clara diferenciación de las muestras de fanerógama de las de los arrecifes rocosos cercanos. Las hojas y los rizomas albergaron biotas claramente distintas, y también se detectaron diferencias entre las dos praderas muestreadas. Esta nueva herramienta tiene el potencial de proporcionar gran cantidad de datos de biodiversidad para hábitats de fanerógamas marinas de manera rápida y eficiente, lo cual es crucial para la implementación de medidas de protección y manejo para este hábitat costero clave.



Imagen de una pradera de Posidonia oceanica en la Isla de Cabrera (foto Kike Ballesteros)

Mapa de calor i agrupación de las muestras obtenidas. El color indica el estrato (barras horizontales) y la pradera (barras verticales) abalizados.