Secuenciación completada!
Nos llevó dos carreras de NovaSeq tener todas las muestras secuenciadas en la compañía Novogene. El primer envío en Abril 21 fue básicamente exitoso pero algunas muestras fallaron debido a la baja concentración de DNA obtenida con el método de extracción. Hay que hacer notar que, debido a los problemas de suministro relacionados con la pandemia por covid19, no pudimos comprar el kit de extracción habitual (PowerMax Soil Kit) y el kit alternativo no funcionó como esperábamos.
En cuanto pudimos adquirir el kit habitual repetimos las extracciones fallidas de este y otros proyectos y una segunda librería fue preparada en Tromso y secuenciada en Novogene en Diciembre 21.
Después de combinar las dos carreras, ahora tenemos el COI de todas las muestras secuenciao, con una profundidad de cerca de un millón de secuencias por muestra. El 12S se secuenció en un aparato MiSeq en Tromso en Noviembre 21. Tenemos por tanto todo secuenciado y estamos iniciando los análisis bioinformáticos. Esperando resultados pronto!
